《中国时报》分析文章说，简单说，马萧配狂胜的意义，就象征陈水扁执政的彻底失败。扁政府政绩不佳，从府到院官箴败坏，阁员失言败德，贪污舞弊频传，第一家庭又形象恶劣，导致民心尽失，是马萧配能重挫对手主因；换个角度看，谢长廷背上陈水扁的包袱，也是他大败主因。

　　第二个重要关键原因，就是国民党在大选失败两次后，痛定思痛，彻底走向转型本土化，也让马突破族群魔咒的藩篱。而马英九则是国民党走上本土化的重要根源。马个人自多年前开始，年年纪念二二八，赢得家属谅解与尊重；在挚友台大教授王晓波的协助下，马英九在担任国民党主席首日，就抛出“先连结台湾才有中国”的台湾本土论述，逐步改变了国民党“外来政权”形象，让国民党逐渐转型为“新国民党”。

　　国民党中央方面，也同步进行大幅改革。包括刊登台独列为人民选项广告、修改党章“去统加台湾”，让台湾人民更认同国民党。到最后马英九下中南部的长住（long stay），这一连串本土化的实践，事后证明奏效。

　　最后，恐怕也是最关键的原因，就是马英九个人品牌的成功。不光是党内同志，即使是政敌也承认，马英九这人尽管有若干缺点，但大抵可称得上是君子。其从政纪录中，近乎龟毛的洁癖性格，赢得李登辉“clean（干净）”评语，足见其经营形象有成。即使选前曾因特别费案被起诉，但一、二审判决让他全身而退，司法过关；加上扁政府贪污腐败强烈的对照，相形之下民众更愿意相信马英九。

　　其实，简单归结，马英九的胜利，其实就是三个字：“陈水扁”。若说马英九在台北市长选举击败陈水扁，成就了陈水扁的总统路，陈水扁这八年的执政失败，也成就了马英九的总统路。这是历史的吊诡，也是台湾的命运。